I Kurofune Samurai kommer du att hjälpa en samurajer att slåss mot en grupp ninjakrigare. Framför dig på skärmen kommer du att se platsen där din samuraj och hans motståndare beväpnade med svärd kommer att befinna sig. Du måste slå med ditt svärd för att förstöra fienden och få poäng för detta i spelet Kurofune Samurai. Efter döden kan du plocka upp troféer som släpps av ninjan.