I Son Goku Vs Naruto måste du delta i striderna mellan det blå laget och det röda laget. Efter att ha valt sidan av konfrontationen, kommer du att befinna dig med ditt lag i startområdet. Med hjälp av kontrolltangenterna får du din hjälte att flytta runt på platsen. Så snart du märker fienden måste du fånga honom i siktet och öppna eld för att döda. Genom att skjuta korrekt kommer du att förstöra dina motståndare och för detta kommer du att få poäng i spelet Son Goku Vs Naruto.