Flottan är avgörande för krigföring, och i Ships of War har du kommandot över ett krigsfartyg. Du måste skydda militärbasen, som ligger på öppet hav. Du kommer att attackeras av fiendens skepp och du kommer att behöva förstöra dem. Skickligt manövrerande måste du föra ditt skepp till ett skottavstånd och attackera fienden. Du kan skjuta kanoner eller använda torpeder som kommer att finnas på skeppet i Ships of War-spelet. Efter att ha förstört fienden kommer du att kunna plocka upp olika användbara föremål från vattnet.