Vetenskap och magi konkurrerade med varandra hela tiden, och utvecklades parallellt. Under en lång tid gick de inte in i öppen konflikt, men med tillkomsten av en ny skola av magi, där hjältinnorna i Magical Girls-spelet tränas, började teknikerna frukta att de skulle tvingas bort från denna värld. De skickade robotar för att förstöra skolan och eleverna måste försvara sig. I spelet Magical Girls måste flickor sätta sina färdigheter i arbete och visa att de har lärt sig av en anledning. Använd ikonerna längst ner på skärmen för att sopa bort alla fiender.